MC2
MC2 est un projet du pôle Astra (Analyse stratégique de l'information) de la DipSO visant à mutualiser les mots-clés employés dans les différentes études de bibliométrie et de veille. MC2 permettra aux utilisateurs de trouver l’information relative aux différentes études et projets archivés via une interface d’interrogation sur les métadonnées (nom de l’étude, texte intégral, auteurs, structures institutionnelles, ...)
MC2 est un projet du pôle Astra (Analyse stratégique de l'information) de la DipSO visant à mutualiser les mots-clés employés dans les différentes études de bibliométrie et de veille. MC2 permettra aux utilisateurs de trouver l’information relative aux différentes études et projets archivés via une interface d’interrogation sur les métadonnées (nom de l’étude, texte intégral, auteurs, structures institutionnelles, ...)
ShinyIDEA
L'application permet d'insérer un fichier de données issues d'une méthode que l'on développe dans l'UR (méthode IDEA), de visualiser des premiers résultats synthétiques puis d'exporter des rapports complets sous différents formats (PDF, DOCX, PPTX, XLSX...)
L'application permet d'insérer un fichier de données issues d'une méthode que l'on développe dans l'UR (méthode IDEA), de visualiser des premiers résultats synthétiques puis d'exporter des rapports complets sous différents formats (PDF, DOCX, PPTX, XLSX...)
MAKAHO
MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les #tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la #significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en #relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.
MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les #tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la #significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en #relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.
GraphstatsR
GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format.
GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format.
ExploreMetabar
ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
Automne
L'application Automne permet le pré-traitement des données de comportement issues des colliers Médria: agréger des datasets, détecter les données manquantes, produire des calculs simples (budgets temps, durées, fractionnement et synchronisation des activités...), et télécharger les résultats produits.
L'application Automne permet le pré-traitement des données de comportement issues des colliers Médria: agréger des datasets, détecter les données manquantes, produire des calculs simples (budgets temps, durées, fractionnement et synchronisation des activités...), et télécharger les résultats produits.
MATrixApp
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr.
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr.
Alpages Sentinelles
L'application sert à visualiser des indicateurs climatiques (graphes) pour des alpages, elle est réalisé dans le cadre du projet de recherche Alpages Sentinelles mené au LESSEM. L'utilisateur selectionne un pixel sur une carte afin d'afficher les graphes correspondants à ce pixel, il peut aussi choisir d'autre paramètre comme la période.
L'application sert à visualiser des indicateurs climatiques (graphes) pour des alpages, elle est réalisé dans le cadre du projet de recherche Alpages Sentinelles mené au LESSEM. L'utilisateur selectionne un pixel sur une carte afin d'afficher les graphes correspondants à ce pixel, il peut aussi choisir d'autre paramètre comme la période.
Oriole
A web application for the automatic filtering of outliers in databases produced by the Walk-over-Weighing (WoW) platform.
A web application for the automatic filtering of outliers in databases produced by the Walk-over-Weighing (WoW) platform.
Geoflow
Geoflow permet d'automatiser la publication de données et métadonnées sur une multitude de catalogues et d'entrepôts (RDG, geonetwork, PNDB, geoserver ...).
Geoflow permet d'automatiser la publication de données et métadonnées sur une multitude de catalogues et d'entrepôts (RDG, geonetwork, PNDB, geoserver ...).
MF1_2_ASCROM_1ha Simulator
Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.
Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.
XSeeker
Webapp to visualise msms data from any molecule. Takes some mzxml files and process/display them, or, uses a sqlite file produced by xseeker preparator to display ms data and annotate them.
Webapp to visualise msms data from any molecule. Takes some mzxml files and process/display them, or, uses a sqlite file produced by xseeker preparator to display ms data and annotate them.
SAMBA
SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
CHaMP
CHaMP is an RShiny app that loads a list of compound masses from twin-peaks analysis, and build a mass difference network from which is extracted the connected component containing a mass of interest. It provides a network visualization of the sub-network that encompass potential metabolic and spontaneous reactions that leads to degradation/metabolization products.
CHaMP is an RShiny app that loads a list of compound masses from twin-peaks analysis, and build a mass difference network from which is extracted the connected component containing a mass of interest. It provides a network visualization of the sub-network that encompass potential metabolic and spontaneous reactions that leads to degradation/metabolization products.
csteviz
Visualisation de données et calcul d'indicateurs importants dans le cadre du suivi du plan Ecophyto.
Visualisation de données et calcul d'indicateurs importants dans le cadre du suivi du plan Ecophyto.