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DataViz

XSeeker XSeeker Webapp to visualise msms data from any molecule. Takes some mzxml files and process/display them, or, uses a sqlite file produced by xseeker preparator to display ms data and annotate them.
SAMBA SAMBA SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
CHaMP CHaMP CHaMP is an RShiny app that loads a list of compound masses from twin-peaks analysis, and build a mass difference network from which is extracted the connected component containing a mass of interest. It provides a network visualization of the sub-network that encompass potential metabolic and spontaneous reactions that leads to degradation/metabolization products.
csteviz csteviz Visualisation de données et calcul d'indicateurs importants dans le cadre du suivi du plan Ecophyto.
CiTIQUE-TRACKER CiTIQUE-TRACKER CiTIQUE-TRACKER est un outil interactif de visualisation des données générées par les citoyens dans le cadre du programme CiTIQUE (recensement des piqûres de tiques).
premhyce premhyce Interface de visualisation des prévisions d'étiage produites par la plateforme PREMHYCE en temps réel sur les bassins versants de France métropolitaine et de La Réunion.
Visual Diatoms Visual Diatoms L'application permet de visualiser graphiquement les données diatomées disponibles sur la base publique NAIADES. Des graphiques, des cartes et des tableau condensent l’information pour rendre les données plus intuitives et interactives
DRYvER-Hydro DRYvER-Hydro This application allows to visualise the spatio-temporal patterns of flow intermittence in river systems and their evolution over recent decades (1980-2021) and under climate change scenarios (2015-2100). The flow intermittence indicators are derived from spatially distributed hydrological modelling of the 6 European river systems studied as part of the DRYvER (Drying rivers and climate change) research project.
BoxplotExplorer BoxplotExplorer Représentation de box-plot à partir d'une matrice de données expérimentale. Objectif : Exploration interactive d'une matrice de données pour la recherche de variables réagissant différemment à une condition expérimentale donnée.
ccsafe-pilote-shiny ccsafe-pilote-shiny
sepim-satellite sepim-satellite Sugarbeet yellows prediction based on Sentinel2-satellite data
sepim-y-predict sepim-y-predict Sugarbeet yellows prediction based on risk factors related to the environment and agricultural practices
AgroforesTreeAdvice AgroforesTreeAdvice AgroforesTreeAdvice est un comparateur d’avis sur les essences d’arbres à planter en agroforesterie: il regroupe, sous une interface unique et multilingue, plusieurs outils de sélection d'arbres (espèces, variétés, porte-greffes) développés dans plusieurs pays.
rflomics rflomics L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq,proteomics et metabolomics (pour le moment).
Application de visualisation des maladies du bois de la vigne Application de visualisation des maladies du bois de la vigne Cette application présente différents tableaux de bords interactifs sur la base de données d'observations et d'incidences des maladies du bois de la vigne dans les grands bassins viticoles du territoire français.
SequencesRPG SequencesRPG Carte leaflet à l'échelle de la France entière permettant de visualiser la diversité des cultures dans le temps, sur la période 2015-2021. Les données sont des rasters fournies au format .tif et contiennent des données sur le nombre de cultures, de familles botaniques, si la séquence de culture est en monoculture ou quasi-monoculture de maïs ainsi qu'un calcul de l'inverse de l'indice de Simpson (indice de diversité).
Piquet Phacc Piquet Phacc Visualisation/récupération des données (photos et mesures environnementales) acquises par le dispositif 'Piquet connecté' développé au sein de l'UE PHACC (B. Adam, N. Drogue).
Meteo Phacc Meteo Phacc MeteoPhacc permet la visualisation de données météorologiques mesurées par les stations du réseau agroclim, associées avec des prévisions météorologiques du site météociel.
ExplorPAB ExplorPAB ExplorePAB est une interface permettant d'explorer les données 'Prime Air Bois' de l'ADEME et l'AGEDEN sur les territoires du Grésivaudan, Pays Voironnais, et Grenoble-Alpes-Métropole. Les visualisations sont faites à partir des dossiers de demande de primes suite au remplacement d'un équipement de chauffage au bois. Elles visent à mieux comprendre le comportement des demandeurs sur le territoire
easyReg easyReg EasyReg is a web application developed in R using Shiny that fits polynomial, sigmoidal, and spline regressions onto the data uploaded by the user, with a variety of fitting and display options. It also shows comparative R-squared and deviance graphs to better choose the fitting options best tailored to the data; it displays the first derivative and allows for the prediction and download of new values following the fitting model.
Rosetta Rosetta Application pour l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.
maelia-itk maelia-itk Cette application fournit une interface graphqique pour la saisie des itinéraires techniques et de leurs règles de décision. Elle génère un fichier faisant partie des données d'entrée de la plateforme de modélisation MAELIA.
diaphen-app diaphen-app L'application diaphen-app permet de visualiser les données des capteurs du plateau Diaphen aux personnes qui en ont besoin. Que ce soit pour du pilotage ou pour de la consultation. L'application permet également de transférer les données des expérimentations sur la plateforme PHIS.

Cartographie

MAKAHO MAKAHO MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les #tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la #significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en #relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.
Alpages Sentinelles Alpages Sentinelles L'application sert à visualiser des indicateurs climatiques (graphes) pour des alpages, elle est réalisé dans le cadre du projet de recherche Alpages Sentinelles mené au LESSEM. L'utilisateur selectionne un pixel sur une carte afin d'afficher les graphes correspondants à ce pixel, il peut aussi choisir d'autre paramètre comme la période.
Loup France Evolution Loup France Evolution Cette application est une cartographie interactive de l'évolution de la présence du loup en France, à partir des données Carmen (répartition par mailles).
Loup Ecrins Genetique Loup Ecrins Genetique Cette application est une cartographie interactive de l'évolution de la présence du loup dans le parc national des Ecrins, a partir des données génétique.
PEPR FairCarboN Cartes PEPR FairCarboN Cartes L'application permet de visualiser, pour chaque projet du PEPR FairCarboN, la localisation géographiques de ses UMR (1) et ses terrains étudiées (2) sur 2 cartes leaflet distinctes dans le monde.
BiogeoMed